本品長期大量應用未見嚴重不良反應。 已證明腺苷蛋氨酸既不改變習慣，也無成癮性。 對本品特別敏感的個體，偶可引起晝夜節律紊亂，睡前服用催眠藥可減輕此癥狀。 保持片劑活性成份穩定的酸性環境使有些患者服用本品后會出現燒心感覺和腹部墜漲；以上癥狀均表現輕微，不需要中斷治療。另外，若出現其他癥狀，請與醫生聯系。 抑郁癥患者使用本品出現自殺意識/觀念或行為者極為罕見。（有關情況請參閱[注意事項]及其中的預防措施）。
在臨床試驗中觀察到的不良反應
下農數據來源于22項臨床試驗中入組并接受腺苷蛋氨酸治療的1667名患者。其中，121名患者(7.2％)出現188例不良反應、惡心、腹痛和腹瀉是報告最頻繁的不良反應。無法總是對不良事件與藥品之間的因果關系進行評估。
在上市后觀察或IV期臨床研究中報告的不良反應
免疫系統疾病
過敏反應(如:潮熱，呼吸困難，支氣管痙攣，腰背痛.
胸悶，血壓或心率改變)
精神疾病
焦慮
呼吸、胸腔和縱隔疾病
喉頭水腫
皮膚和皮下組織疾病
注射部位反應(極少數出現皮膚壞死)，血管性水腫，皮
膚變態反應(如:皮疹，島癢，尊麻疹，紅斑)

注射用凍干粉針須在臨用前用所附溶劑溶解。靜脈注射必須非常緩慢。
請不要使用過期藥品, 請遠離熱源。若粉針因為儲存不當而有微小裂口或暴露于熱源, 結晶不是白色時, 應將本品連同整個包裝去藥房退換。
由于維生素 B12和葉酸缺乏可能降低腺苷蛋氨酸濃度，所以應定期監測高危患者的血漿中維生素 B12和葉酸的濃度(貧血癥的患者、肝臟疾病患者、妊娠婦女或由于其它疾病或飲食習慣引起的潛在維生素缺乏的患者-例如素食者)。如果顯示維生素 B12和葉酸缺乏，建議在給予腺苷蛋氨酸治療前或同時給予維生素 B12和或葉酸治療。
一些患者在服用腺苷蛋氨酸的過程中可能出現頭暈。在治療過程中，應建議患者不要駕駛或使用機械，除非他們有理由相信腺苷蛋氨酸治療不影響患者駕駛和使用機械的能力。
配伍禁忌：本品不應與堿性溶液或含鈣溶液混合。
自殺/自殺觀念(具有抑郁綜合征的患者)
抑郁癥與自殺觀念，自傷和自殺行為(自殺/相關的事件)的風險增高相關聯。這種自殺的危險一直都隨抑郁癥存在，直到抑郁癥病情暫時得到緩解和減輕。在治療初期抑郁癥病情可能會無實
質性改善，因而在此期間對患者一定要加強觀察和監護。一些臨床經驗顯示即使在抑郁癥改善初期也可能出現自殺風險增加。
使用本品過程中岀現的其它精神障礙也可能與自殺風險増高有關。此外，這些精神障礙與重性抑郁有關，因此在使用本品治療重性抑郁時應釆取如下的預防措施。
有自殺行為或自殺觀念病史的患者，或者在洽療前即表現出明顯自殺觀念的患者，他們存在自殺觀念或自殺傾向的風險較大，所以在洽療期對這些患者應進行嚴密觀察和監護。比較抗抑郁藥與安慰劑治療精神障礙的臨床硏究結果顯示：抗抑郁藥組 25 歲以下年齡段患者中發生自殺行為的風險更大。
使用抗抑郁藥進行治療時應加強對患者的嚴密觀察和監護，特別是對于自殺風險較大的患者，尤其在治療初期以及劑量調整后，更應加強這種監護。患者(或其護理人員)應被告知其有被監護的必要，一旦發現患者病情惡化，或出現自殺觀念或自殺行為，或出現行為異常改變，應馬上向主管醫生報告。
腺苷蛋氨酸不應用于具有雙相情感暲礙的患者。在應用腺苷蛋氨酸洽療的患者中，岀現抑郁癥轉變成輕度躁狂或躁狂癥的現象。
文獻報道 1 例同時服用腺苷蛋氨酸和氯米帕明的患者岀現了血清素綜合征。盡管僅推測存在相互作用，但在同時給予腺苷蛋氨酸和選擇性 5-羥色胺再攝取抑制劑(SSRs)、三環抗抑郁劑(包括氯米帕明)以及含有色氨酸基團的藥品和植物源性營養補充劑時，應謹慎。
抑郁癥患者出現自殺和其它嚴重事件的風險升高;因此，在應用腺苷蛋氨酸洽療的過程中，應繼續正在迸行的精神病學洽療，以確保適當考慮并治療抑郁癥狀。
有報告些患者服用腺苷蛋氨酸后出現短暫焦慮或焦加重。大部分情況下，不必中斷治療。少數情況下，需減少劑量或中斷洽療以緩解焦慮。
腎功能障礙患者
尚未在腎功能受損患者中開展硏究。因此，該類患者使用腺苷蛋氨酸時應謹慎。
對高半胱氨酸免疫測定的干擾：
腺苷蛋氨酸干擾高半胱氨酸的免疫測定。服用腺苷蛋氨酸的患者，該方法可能測岀錯誤的高半肜氨酸水平。因此，服用腺苷蛋氨酸的患者應采用非免疫分析方法檢測血液高半胱氨酸水平。

腺/苷蛋氨酸是人體組織和體液中普遍存在的一種生理活性分子。它作為甲基供體(轉甲基作用)和生理性巰基化合物(如半胱氨酸、牛磺酸、谷胱甘肽和輔酶 A 等的-前體(轉硫基作用參與體內重要的生化反應。在肝內，通過使質膜磷脂甲基化而調節肝臟細胞膜的流動性，而且通過轉硫基反應可以促進解毒過程中硫化產物的合成。只要肝內腺苷蛋氨酸的生物利用度在正常范圍內，這些反應就有助于防止肝內膽汁淤積。
現已發現，肝硬化時肝腺苷蛋氨酸的合成明顯下降，這是因為腺苷蛋氨酸合成酶(催化必需氨基酸蛋氨酸向腺苷蛋氨酸轉化)的活性顯著下降(約 50％ 所致。這種代謝障礙使蛋氨酸向腺苷蛋氨酸轉化減少，因而削弱了防止膽汁淤積的正常生理過程。結果使肝硬化患者飲食中的蛋氨酸血漿清除率降低，并造成其代謝產物，特別是半胱氨酸、谷胱甘肽和牛磺酸利用度的下降。而且這種代謝障礙還造成高蛋氨酸血癥，使發生肝性腦病的危險性增加。有研究證明體內蛋氨酸累積可導致其降解產物(如硫醇，甲硫醇)在血中的濃度升高，而這些降解產物在肝性腦病的發病機理中起重要作用。由于腺苷蛋氨酸可以使巰基化合物合成增加，但不增加血循環中蛋氨酸的濃度，給肝硬化患者補充腺苷蛋氨酸可以使一種在肝病時生物利用度降低的必需化合物恢復其內源性水平。
肝內膽汁淤積
肝內膽汁淤積可能是急性和慢性肝病的并發癥，而且不管它們的病因如何，這種并發癥都可能發生。這是由于肝細胞分泌膽汁減少，因而本應隨著膽汁被清除的物質在血液中聚積，特別是膽紅素，膽鹽和各種酶。肝內膽汁淤積臨床表現為黃疸和/或瘙癢，生化改變特點是血液中膽汁的成分(主要是總膽紅素和結合膽紅素，膽鹽)和膽管酶堿性磷酸酶和γ-谷氨酰轉移酶升高。補充腺苷蛋氨酸可以消除因腺苷蛋氨酸合成酶活性降低而造成的代謝阻滯，恢復膽汁排泌的生理機制。事實上各種實驗模型證明，腺苷蛋氨酸抗膽汁淤積的活性應歸于：1. 通過依賴腺苷蛋氨酸合成膜磷酯(降低膽固醇與磷酯的比例恢復細胞膜的流動性;2. 通過轉硫基途徑合成參與內源解毒過程的含硫化合物。
本品沒有致突變作用，也不影響動物的生育能力，在整個孕期本品既不干擾動物胚胎的形成，也不影響胎仔的發育。